MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 6803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017177	TTTA	2	8	3	10	25 %	75 %	0 %	0 %	384359038
2	NC_017177	AAT	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359038
3	NC_017177	TTG	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359038
4	NC_017177	AT	3	6	169	174	50 %	50 %	0 %	0 %	384359038
5	NC_017177	AT	4	8	189	196	50 %	50 %	0 %	0 %	384359038
6	NC_017177	T	7	7	210	216	0 %	100 %	0 %	0 %	384359038
7	NC_017177	A	6	6	269	274	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
8	NC_017177	AAT	2	6	280	285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
9	NC_017177	AGA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359039
10	NC_017177	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359039
11	NC_017177	A	6	6	354	359	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
12	NC_017177	A	6	6	371	376	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
13	NC_017177	AT	5	10	380	389	50 %	50 %	0 %	0 %	384359039
14	NC_017177	AAT	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
15	NC_017177	A	7	7	408	414	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
16	NC_017177	TAT	2	6	429	434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359039
17	NC_017177	TAA	3	9	438	446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
18	NC_017177	ATT	2	6	450	455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359039
19	NC_017177	T	6	6	454	459	0 %	100 %	0 %	0 %	384359039
20	NC_017177	A	7	7	477	483	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
21	NC_017177	ATT	2	6	497	502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359039
22	NC_017177	TA	3	6	533	538	50 %	50 %	0 %	0 %	384359039
23	NC_017177	TTTG	2	8	540	547	0 %	75 %	25 %	0 %	384359039
24	NC_017177	A	7	7	556	562	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
25	NC_017177	TGTT	2	8	606	613	0 %	75 %	25 %	0 %	384359039
26	NC_017177	TA	3	6	668	673	50 %	50 %	0 %	0 %	384359039
27	NC_017177	A	7	7	675	681	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
28	NC_017177	AATA	2	8	717	724	75 %	25 %	0 %	0 %	384359039
29	NC_017177	AAG	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359039
30	NC_017177	TAA	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
31	NC_017177	ATTT	2	8	935	942	25 %	75 %	0 %	0 %	384359039
32	NC_017177	A	6	6	979	984	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
33	NC_017177	TGTT	2	8	1010	1017	0 %	75 %	25 %	0 %	384359039
34	NC_017177	TAA	2	6	1033	1038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
35	NC_017177	GAA	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359040
36	NC_017177	TAA	2	6	1900	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359040
37	NC_017177	CTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359040
38	NC_017177	GAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359040
39	NC_017177	TAA	2	6	2006	2011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359040
40	NC_017177	A	6	6	2082	2087	100 %	0 %	0 %	0 %	384359040
41	NC_017177	AT	4	8	2125	2132	50 %	50 %	0 %	0 %	384359040
42	NC_017177	A	6	6	2209	2214	100 %	0 %	0 %	0 %	384359040
43	NC_017177	CAG	2	6	2215	2220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359040
44	NC_017177	ATT	2	6	2276	2281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359040
45	NC_017177	TTA	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
46	NC_017177	TAA	2	6	2430	2435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
47	NC_017177	GAA	3	9	2477	2485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359041
48	NC_017177	AATA	2	8	2495	2502	75 %	25 %	0 %	0 %	384359041
49	NC_017177	ATA	2	6	2511	2516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
50	NC_017177	ATT	4	12	2560	2571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
51	NC_017177	ATTT	2	8	2580	2587	25 %	75 %	0 %	0 %	384359041
52	NC_017177	ATT	3	9	2634	2642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
53	NC_017177	ATT	3	9	2646	2654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
54	NC_017177	TAA	2	6	2671	2676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
55	NC_017177	TAA	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
56	NC_017177	TTA	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
57	NC_017177	ATA	2	6	2739	2744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
58	NC_017177	AT	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	384359041
59	NC_017177	TA	4	8	2771	2778	50 %	50 %	0 %	0 %	384359041
60	NC_017177	ATATA	2	10	2824	2833	60 %	40 %	0 %	0 %	384359041
61	NC_017177	T	7	7	2868	2874	0 %	100 %	0 %	0 %	384359041
62	NC_017177	AGA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359041
63	NC_017177	A	8	8	2903	2910	100 %	0 %	0 %	0 %	384359041
64	NC_017177	AAC	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359041
65	NC_017177	GA	3	6	2998	3003	50 %	0 %	50 %	0 %	384359041
66	NC_017177	TTA	2	6	3066	3071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
67	NC_017177	TA	4	8	3103	3110	50 %	50 %	0 %	0 %	384359041
68	NC_017177	TAAA	2	8	3113	3120	75 %	25 %	0 %	0 %	384359041
69	NC_017177	A	7	7	3469	3475	100 %	0 %	0 %	0 %	384359042
70	NC_017177	TAT	2	6	3502	3507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359042
71	NC_017177	ATA	2	6	3559	3564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359042
72	NC_017177	T	7	7	3582	3588	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
73	NC_017177	TTCTT	2	10	3599	3608	0 %	80 %	0 %	20 %	384359042
74	NC_017177	TTTA	2	8	3625	3632	25 %	75 %	0 %	0 %	384359042
75	NC_017177	GT	3	6	3744	3749	0 %	50 %	50 %	0 %	384359042
76	NC_017177	T	6	6	3785	3790	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
77	NC_017177	TC	3	6	3815	3820	0 %	50 %	0 %	50 %	384359042
78	NC_017177	TC	3	6	3840	3845	0 %	50 %	0 %	50 %	384359042
79	NC_017177	ACAT	2	8	3870	3877	50 %	25 %	0 %	25 %	384359042
80	NC_017177	TCT	2	6	3878	3883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359042
81	NC_017177	TA	3	6	3924	3929	50 %	50 %	0 %	0 %	384359042
82	NC_017177	AAC	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359042
83	NC_017177	T	7	7	3955	3961	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
84	NC_017177	TTC	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359042
85	NC_017177	CAA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359042
86	NC_017177	CTTTT	2	10	4017	4026	0 %	80 %	0 %	20 %	384359042
87	NC_017177	T	6	6	4023	4028	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
88	NC_017177	T	8	8	4075	4082	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
89	NC_017177	T	9	9	4165	4173	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
90	NC_017177	TAAA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	384359042
91	NC_017177	ATT	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
92	NC_017177	AGA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359043
93	NC_017177	TTA	2	6	4403	4408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
94	NC_017177	GAG	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359043
95	NC_017177	ATG	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359043
96	NC_017177	A	6	6	4482	4487	100 %	0 %	0 %	0 %	384359043
97	NC_017177	TCA	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359043
98	NC_017177	TTG	2	6	4539	4544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359043
99	NC_017177	TATT	2	8	4565	4572	25 %	75 %	0 %	0 %	384359043
100	NC_017177	T	7	7	4662	4668	0 %	100 %	0 %	0 %	384359043
101	NC_017177	ATT	2	6	4671	4676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
102	NC_017177	AAATCT	2	12	4729	4740	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384359043
103	NC_017177	ATTT	2	8	4764	4771	25 %	75 %	0 %	0 %	384359043
104	NC_017177	T	6	6	4769	4774	0 %	100 %	0 %	0 %	384359043
105	NC_017177	CTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359043
106	NC_017177	AATTA	2	10	4782	4791	60 %	40 %	0 %	0 %	384359043
107	NC_017177	AAGC	2	8	4796	4803	50 %	0 %	25 %	25 %	384359043
108	NC_017177	CTT	2	6	4808	4813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359043
109	NC_017177	T	6	6	4812	4817	0 %	100 %	0 %	0 %	384359043
110	NC_017177	ATT	2	6	4821	4826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
111	NC_017177	T	7	7	4842	4848	0 %	100 %	0 %	0 %	384359043
112	NC_017177	ATTC	2	8	4880	4887	25 %	50 %	0 %	25 %	384359043
113	NC_017177	GTT	2	6	4913	4918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359043
114	NC_017177	TGT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359043
115	NC_017177	TAT	2	6	4962	4967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
116	NC_017177	GTA	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359043
117	NC_017177	ACTT	2	8	5060	5067	25 %	50 %	0 %	25 %	384359043
118	NC_017177	T	7	7	5099	5105	0 %	100 %	0 %	0 %	384359043
119	NC_017177	TAT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
120	NC_017177	T	7	7	5118	5124	0 %	100 %	0 %	0 %	384359043
121	NC_017177	TAT	2	6	5130	5135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
122	NC_017177	T	6	6	5177	5182	0 %	100 %	0 %	0 %	384359043
123	NC_017177	TTA	2	6	5201	5206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
124	NC_017177	TCT	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359043
125	NC_017177	TCT	2	6	5254	5259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359043
126	NC_017177	ATT	3	9	5302	5310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
127	NC_017177	ATT	2	6	5326	5331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
128	NC_017177	T	6	6	5335	5340	0 %	100 %	0 %	0 %	384359043
129	NC_017177	ATT	2	6	5575	5580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359044
130	NC_017177	TAA	2	6	5586	5591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359044
131	NC_017177	AAAG	2	8	5651	5658	75 %	0 %	25 %	0 %	384359044
132	NC_017177	TTA	2	6	5667	5672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359044
133	NC_017177	T	6	6	5691	5696	0 %	100 %	0 %	0 %	384359044
134	NC_017177	ATAA	2	8	5822	5829	75 %	25 %	0 %	0 %	384359044
135	NC_017177	TAC	2	6	5830	5835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359044
136	NC_017177	AT	3	6	5859	5864	50 %	50 %	0 %	0 %	384359044
137	NC_017177	TAA	2	6	5915	5920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359045
138	NC_017177	TCT	2	6	5976	5981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359045
139	NC_017177	T	7	7	6032	6038	0 %	100 %	0 %	0 %	384359045
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